Науковці США взялися за масштабне картування ґрунтового мікробіому

Генетики Університету Джонса Гопкінса разом із великою мережею дослідників з усієї країни, зокрема студентами, працюють над каталогізацією ґрунтового мікробіому Сполучених Штатів — одного з найменш вивчених компонентів біосфери.

Джерело: phys.org

Цей проєкт є одним із найбільших мікробіомних досліджень у світі. Завдяки сучасним технологіям аналізу ДНК команді вже вдалося виявити понад тисячу нових штамів бактерій і раніше невідомих мікроорганізмів. Водночас це лише незначна частина так званої мікробної «темної матерії».

За словами старшого автора дослідження Майкла Шаца, провідного фахівця з геноміки, заповнити прогалини у знаннях про мікробне різноманіття можливо лише завдяки широкій мережі науковців і студентів. Він наголошує, що ґрунт є найбільш біологічно активним середовищем на Землі, але людство досі дослідило лише малу частину організмів, які в ньому мешкають.

Опис проєкту опубліковано в журналі Nature Genetics. У ньому підкреслюється, що ґрунт є найрізноманітнішим середовищем на планеті та домівкою для більш ніж половини всіх відомих видів, а також мільйонів бактерій, архей, вірусів і грибів.

Деякі ґрунтові мікроорганізми є критично важливими для екосистем і життя людей, тварин та рослин. Інші ж пов’язані з розвитком стійкості до антибіотиків, що становить серйозну загрозу для охорони здоров’я. За оцінками науковців, близько 99 відсотків ґрунтових мікроорганізмів досі не вивчені.

Консорціум BioDiversity and Informatics for Genomics Scholars (BioDIGS) охоплює понад 40 локацій у різних штатах. У проєкті беруть участь близько 150 дослідників із десятків установ. Зразки ґрунту збирають у містах і сільській місцевості — від парків і ферм до лісів, кампусів і територій поблизу екологічно небезпечних об’єктів.

Окрім заповнення наукових прогалин, BioDIGS має й освітню мету: проєкт залучає нове покоління генетиків, розширює навчальні програми та вже об’єднав понад сотню студентських дослідників. Науковці очікують, що з розширенням роботи до проєкту долучатиметься дедалі більше молодих фахівців.